2021年12月23日妖媚婷儿 户外，《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）在线发表了东谈主类遗传学与东谈主类学系徐书华西席团队的商讨遵守“Genetic connections and convergent evolution of tropical indigenous peoples in Asia”。商讨团队产生和网罗了行家热带地区近1000例原住民的基因型数据（见图1），要点分析了来自南亚的安达曼群岛、东南亚的马来半岛和菲律宾群岛以及大洋洲的新几内亚岛的原住民全基因组测序数据，系统商讨了东谈主群的遗传关系、祖源组成和迁移历史，并以深肤色为例探索东谈主群符合性进化的遗传机制，为证据当代东谈主类表型万般性产生和和演化机制商讨提供了参考模子和典型案例。
图1 商讨触及的热带原住民东谈主群散布
相片着手网站：https://www.gettyimages.in/，https://www.pinterest.com和https://www.vladivlad.com；部分相片由马来西亚UCSI大学Boon-Peng Hoh西席团队提供。
要是说当代东谈主类的演化是一部明后的汗青，那么东南亚必定是其中不能或缺的迫切篇章。东南亚地处团结亚洲和大洋洲、印度洋和太平洋的交通要谈，且东谈主口粘稠，蚁集了宇宙上现有的大多半原住民族群。比年来，以东南亚为中心平素散布的亚洲热带原住民族群缓缓引起了东谈主类学、遗传学、考古学等限度学者的嗜好，成为商讨当代东谈主类跨时空迁移、会通并不停符合新环境的复杂流程的迫切冲破口。在热带地区考古资源相对穷乏的情况下，原住民族群的商讨关于修起当代东谈主类发源和演化的几个关节问题具有迫切真义。
黑丝美女问题一：当代东谈主“走出非洲”的历程是若何的？从非洲至亚洲的迁移是如何发生的？
曾有学者臆想，散布在安达曼群岛、马来半岛、菲律宾群岛和新几内亚岛的原住民可能代表了最早从非洲迁移至亚洲的当代东谈主的一支，但现在仍穷乏鼓胀的笔据因循。该商讨团队发现，行家热带原住民族群的总体遗传关系与其地舆散布密切干系，其中亚洲地区的族群在常染色体、线粒体DNA和Y染色体上均施展出较大的遗传互异和复杂的祖源组成。关联词，真义的是，商讨东谈主员在不同亚洲热带原住民族群中均检测到一个底层亚洲先人身分（the basal Asian ancestry），该身分尤其富集在安达曼群岛、马来半岛、菲律宾群岛和新几内亚岛的原住民基因组中，而并不存在于亚洲以外的地区。通过与行家史前当代东谈主和历史更为久远的古东谈主（如尼安德特东谈主和丹尼索瓦东谈主）基因组对比妖媚婷儿 户外，商讨东谈主员抹杀了该早期亚洲先人身分着手于古东谈主对当代东谈主基因浸透的可能性，况且发现该身分在旧石器期间晚期（距今约5万年）的亚洲东谈主中相对富集，况且跟着古DNA样本测年推近而缓缓减少。该商讨进一步构建了东谈主群遗传搀和模子，提倡该身分最有可能是最早从非洲沿亚洲南部海岸线迁移至东南亚和大洋洲地区的亚洲先人东谈主群的遗存（见图2）。根据早期亚洲先人身分的东谈主群散布规则，商讨东谈主员在不借助任何古DNA的情况下，从现有的亚洲热带原住民基因组中已然出代表该身分的基因片断，发现其可能与东谈主群的毛发方法（如LIMS1基因）、骨骼发育（如COL24A1基因）等的符合性进化具有密切关联。
图2 早期亚洲先人身分的行家散布以及由此臆想的亚洲东谈主群早期迁移道路
问题二：当代东谈主的环境符合性表型是如何产生的？某些非洲和亚洲热带原住民的“趋同表型”，如矮肉体、深肤色、卷毛发、宽鼻翼等，是从共同先人经受而来的特征，如故东谈主群分化后各自演化而来？
该商讨基于文件和数据库报谈的1057个色素干系基因和其中包含的103个功能效应明确的位点，对其在行家东谈主群中的遗传变异模式进行分析，归纳出几种可能的演化模子（见图3）。其一，着手于共同先人的肤色干系变异在东谈主群不对后发生平行进化。分析线路，之前基于非洲东谈主群的商讨报谈的绝大多半深肤色关联变异（如位于DDB1/DAK基因中的多少变异），在亚洲热带原住民东谈主群中也以一定的频率存在，况且佩带这类变异的单倍型为当代东谈主中较为陈腐的类型，这标明前述亚洲早期先人身分可能组成了该地区原住民东谈主群深肤色表型的部分遗传基础。其二，东谈主群不对后在其各自的演化历程平永诀得回调换的肤色干系变异，即趋同进化。一种可能的着手是沉静发生的古东谈主基因浸透事件，古东谈主与亚洲热带原住民的遗传搀和可能在后者基因组中从头引入了“走出非洲”时如故丢失的深肤色干系变异（如与紫外线调控叶酸水平干系的MTHFD1基因）；另一种可能的着手是沉静发生的新发突变，举例多个亚洲热带原住民东谈主群在参与紫外线指导的DNA毁伤缔造的基因STK11上佩带吞并新发突变，固然不同东谈主群沉静发生新发突变的概率较小，但就现在的分析无法实足抹杀其可能性。相同真义的是，商讨东谈主员还发现了基因水平的趋同进化特征，即不同东谈主群在吞并基因的不同区域发生遗传符合，比如受古东谈主基因浸透影响发生正聘用的RAD18基因（参与紫外线指导的DNA毁伤缔造）和受负聘用影响的MC1R基因（参与多物种色素决定的著名基因）。本商讨未触及肤色表型数据分析，根据已知功能的基因变异和其东谈主群散布规则来设立基因和表型的掂量，这正体现了群体遗传和洽商生物学的特色和上风。诚然，肤色的决定因素极度复杂，本商讨构建的模子无法包揽统共场景与细节，但预期为今后更深化、更概括的机制和功能商讨提供表面依据。
图3 深肤色干系基因变异的遗传演化模子
本商讨使命由徐书华西席团队和马来西亚USCI大学Boon-Peng Hoh西席团队共同完成。复旦大学生命科学学院后生商讨员邓恋博士和博士生潘雨闻（中国科学院上海养分与健康商讨所）为本文共同第一作家；徐书华西席为该文通信作家。复旦大学生命科学学院为第一单元与通信作家单元。
该项使命得到了国度当然科学基金委、中国科学院、英国皇家学会牛顿基金、国度要点研发蓄意、上海市科委、马来西亚高档援助部和科技翻新部等多项基金的资助，同期得到马来西亚原住民事务单元的因循。极度致谢为本商讨提供样本的马来西亚单元和志愿者！
论文邻接：https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab361/6481554